Robotics-inspired methods to enhance protein design

Laurent Denarie 1
1 LAAS-RIS - Équipe Robotique et InteractionS
LAAS - Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes [Toulouse]
Résumé : La conception de protéines ayant des propriétés spécifiques représente un enjeux majeur pour la pharmacologie et les bio-technologies. Malgré les progrès des méthodes de CAO développées pour la conception de protéines, une limitation majeure des techniques existantes vient de la difficulté à prendre en compte la mobilité du squelette protéique, afin de mieux capturer l’ensemble des propriétés des protéines candidates et garantir la bonne stabilité de la protéine choisie dans la conformation voulue. De plus, si des méthodes de conception multi-états ont été proposées, elles ne permettent pas de garantir l’existence d’une trajectoire réaliste entre ces états. De ce fait, la conception de protéines devant permettre la transition entre plusieurs états reste un problème hors de la portée des méthodes actuelles. Cette thèse explore comment des algorithmes inspirés de la robotique peuvent être utilisés pour explorer l’espace conformationnel de manière efficace afin d’améliorer les méthodes de conception de protéines en prenant en compte de manière plus poussée la flexibilité de leur squelette. Ce travail pose également un premier jalon vers une méthode de conception adaptée à la réalisation d’un mouvement de la protéine.
Type de document :
Thèse
Robotics [cs.RO]. INP DE TOULOUSE, 2017. English
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [220 références]  Voir  Masquer  Télécharger

https://hal.laas.fr/tel-01591457
Contributeur : Christine Fourcade <>
Soumis le : jeudi 21 septembre 2017 - 13:58:18
Dernière modification le : mercredi 28 février 2018 - 10:58:19

Identifiants

  • HAL Id : tel-01591457, version 1

Citation

Laurent Denarie. Robotics-inspired methods to enhance protein design. Robotics [cs.RO]. INP DE TOULOUSE, 2017. English. 〈tel-01591457〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

79

Téléchargements de fichiers

83