Etude du rôle des pili de Lactococcus lactis dans la structuration d'un biofilm : approche biophysique multi-échelle - LAAS - Laboratoire d'Analyse et d'Architecture des Systèmes Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2021

Study of the role of Lactococcus lactis pili in biofilm structuring: a multi-scale biophysical approach

Etude du rôle des pili de Lactococcus lactis dans la structuration d'un biofilm : approche biophysique multi-échelle

Résumé

Biofilms can be considered as more or less complex, highly structured microbial communities attached to a surface. In bacteria, biofilms are formed from clusters of cells of one or more species, producing their own exopolymeric, protective and adhesive matrix. This form of community life allows bacteria to protect themselves and resist physical, chemical and biological phenomena. However, in pathogenic and opportunistic bacteria, the formation of biofilm poses significant economic and health problems. In non-pathogenic bacteria, particularly probiotic or lactic acid bacteria (LAB), biofilm formation and its role in controlling other spoilage or pathogenic bacteria is increasingly being studied. From this perspective, the adhesion stage, intercellular interactions and biofilm formation mechanisms are crucial. In recent years, while most work has focused on the probiotic bacterium Lactobacillus rhamnosus GG, the model LAB Lactococcus lactis is also t! he subject of several studies aimed at understanding its ability to adhere to biotic and abiotic surfaces, the mechanisms of cell-cell interactions and biofilm formation, both under static and flowing conditions. In these thesis works, in order to understand the role of L. lactis pili in the organization and cohesion of cells in a biofilm, we first demonstrated, using cell-scale force spectroscopy (SCFS), the involvement of pili in homotypic interactions and their ability to interact with other surface proteins such as Mub proteins. The role of pili in the morphological characteristics of the biofilm (heterogeneous, aerial, rough), related to cell cohesion and its nanomechanical properties was analyzed. The use of a library of strains with different phenotypes has shown that other surface proteins, such as Mub proteins, participate in the structuring and characteristics of the biofilm. On the other hand, this difference in structure between the biofilms of the pili! ated strains does not appear to be correlated with their nanom! echanical properties. All piliated strains have similar mechanical properties: the biofilms are a thousand times softer or more elastic than those of control strains without pili. Finally, under flow conditions, different shear stresses (from 0.02 to 1 Pa) were applied to the biofilms in order to show their effects on both the detachment and the morphology of the biofilm as well as on its development during 24h. Thus, under these flow conditions, the crucial role of pili in the structuring and persistence of L. lactis biofilms was demonstrated.
Les biofilms peuvent être considérés comme des communautés microbiennes plus ou moins complexes, très structurées, attachées à une surface. Chez les bactéries, les biofilms sont formés d’amas de cellules d’une ou de plusieurs espèces, produisant leur propre matrice exo-polymérique, protectrice et adhésive. Cette forme de vie en communauté permet aux bactéries de se protéger et de résister contre des phénomènes physiques, chimiques et biologiques. Cependant, chez les bactéries pathogènes et opportunistes, la formation de biofilm pause d’importants problèmes économiques et sanitaires. Chez les bactéries non-pathogènes, en particulier, les bactéries probiotiques ou les bactéries lactiques (BL), la formation de biofilm et son rôle dans le contrôle d’autres bactéries d’altération ou pathogènes sont de plus en plus étudiés. Dans cette optique, l’étape d’adhésion, les interactions intercellulaires et les mécanismes de formation ! de biofilm sont cruciales. Ces dernières années, si la plupart des travaux s’intéressent à la bactérie probiotique Lactobacillus rhamnosus GG, la BL modèle Lactococcus lactis, fait aussi l’objet de plusieurs études visant à comprendre sa capacité à adhérer sur des surfaces biotiques et abiotiques, les mécanismes d’interactions entre cellules et de formation de biofilms, tant en conditions statiques qu’en écoulement. Dans ces travaux de thèse, pour comprendre le rôle des pili de L. lactis dans l’organisation et la cohésion des cellules dans un biofilm, nous avons d’abord démontré, en utilisant la spectroscopie de force à l’échelle de la cellule (SCFS), l’implication des pili dans les interactions homotypiques et leur capacité à interagir avec d’autres protéines de surface comme les protéines à domaines Mub. Le rôle des pili dans les caractéristiques morphologiques du biofilm (hétérogène, aérien, rugu! eux), en lien avec la cohésion des cellules et ses propriétés nanomécaniques a été analysé. L’utilisation d’une banque de souches aux phénotypes différents a permis de montrer, que d’autres protéines de surface, comme les protéines à domaine Mub, participent à la structuration et aux caractéristiques du biofilm. En revanche, cette différence de structure entre les biofilms des souches pilièes n’apparait pas corrélée à leurs propriétés nanomécaniques. Toutes les souches produisant des pili ont des propriétés mécaniques similaires : les biofilms sont mille fois plus mous ou élastiques que ceux des souches contrôle dépourvues de pili. Enfin, en condition d’écoulement, différentes contraintes de cisaillement (de 0.02 à 1 Pa) ont été appliquées sur les biofilms afin de montrer leurs effets à la fois sur l’arrachement et la morphologie du biofilm ainsi que sur son développement au cours du temps (24h). Ainsi, dans ces conditions d’écoulement, le rôle crucial des pili dans la structura! tion et la persistance des biofilms de L. lactis a été démontré.
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Citer

Dramé Ibrahima. Etude du rôle des pili de Lactococcus lactis dans la structuration d'un biofilm : approche biophysique multi-échelle. Génie des procédés. Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse, 2021. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03246140⟩
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